受历史原因及现实条件影响，电子证照源头多，管理分散，部分地区还存在人工干预行为。导致数据真实性不足、不权威，缺乏一致性和时效性。

由于缺少权威统一的电子认证机构，证照管理标准不统一，各机构数字证书、电子签章样式较多。而往往受网络和认证等条件限制，实时核验能力无法适应需求。

电子证照审批服务流程跨多个部门、系统，层级和地域，单个部门难以进行数据汇聚和共享，也难以快速运用到其他部门，更不提建立互信互认的电子证照共享机制。